Thuốc Bông Sen đã được trao tặng nhiều giải thưởng lớn của Quốc gia:Tinh hoa Việt nam.Cúp vàng Topten sản phẩm uy tín chất lượng.Cúp vàng chất lượng hội nhập hàng đầu.Thương hiệu Việt hội nhập WTO. Top 100 sản phẩm tiêu biểu ứng dụng Khoa học - Công nghệ. Danh hiệu sản phẩm dịch vụ sản xuất - vì sức khỏe và phát triển cộng đồng. Hội Liên hiệp khoa học công nghệ Việt nam (UIA) trao tặng: - Cờ đơn vị xuất sắc trong nghiên cứu, ứng dụng khoa học mười năm liền.- Bằng khen đơn vị xuất sắc trong nghiên cứu khoa học mười năm liền,- Giải thưởng Khoa học công nghệ mười năm liền.- Bằng “Huyền thông Y1000 NO 02 UIA”.